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 CH-AAEB Archives de l’ancien Evêché de Bâle - Archiv des ehemaligen Fürstbistums Basel (09. sc.-19. sc.)
 Principauté et diocèse - Fürstbistum und Diözese (09e s.-18e s.)
 A Spiritualia, administration spirituelle (diocèse) (09e s.-18e s.)
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 A 52-53 Franciscani in et extra episcopatum - Franciscains dans et hors de l'Evêché (1594.02.26-1781.09.28)
A 54 Fundationes - Fondations (1234-1789)
A 55 Grandisvallense Monasterium - Chapitre séculier de Moutier-Grandval (0866-1796)
A 56 Gregorii Sancti in valle Monasterium - Couvent de Munster au Val Saint-Grégoire (Ht-Rhin) (0534-1780)
A 57 Hospitalia - Hôpitaux (1406-1789)
A 58 Jejunia - Jeûnes (1463-1790)
A 59 Immunitas et jurisdictio ecclesiastica - Immunité et juridiction ecclésiastiques (1274-1792)
A 60 Indulta papalia et episcopalia - Indults (concessions) des papes et des évêques (1312-1791)
A 61 Intercessionnes ad ecclesias cathedrales - Intercession de l'évêque en faveur de privés briguant une prébende ou une adm... (1535-1754)
A 62 Investiturae, collationes, admissiones et praesentationes - Investitures, collations, admissions et présentations aux bé... (1503-1792)
A 63 Isenheimis praeceptoria - Commanderie des Antonins d'Issenheim (Ht-Rhin) (1313-1733)
A 64 Isteinensis praepositura - Prieuré d'Istein (Bade-Wurtemberg) (1565-1785)
A 65 Jubilaea et indulgentiae - Jubilés (ordinaires et extraordinaires) et indulgences (1347-1790)
A 66 Jus collaturae et alia jura episcopalia - Droit de collation et autres droits épiscopaux (1698-1791)
A 67 Jus patronatus episcopi Basileensis - Droit de patronage de l'évêque de Bâle (1393-1788)
A 68 Libri prohibiti et approbationes librorum - Listes de livres à l'index et autorisations de lire de tels livres (1523-1787)
A 69 Lubacensis Franciscani - Couvent des Récollets de Luppach (vers Ferrette, Ht-Rhin) (1464-1786)
A 70 Lucellensis abbatia - Abbaye cistercienne de Lucelle (Ht-Rhin) (1124-1790)
A 71 Marbacensis abbatia - Abbaye de Marbach (Ht-Rhin), chanoines réguliers de saint Augustin (1406-1790)
A 72 Mazopolitana abbatia - Abbaye de Masevaux (Ht-Rhin), chapitre de dames nobles (0823-1790)
A 73 Melitensis ordo - Ordre de Malte ou de Saint-Jean de Jérusalem (1586-1784)
A 74 Michaelis s. confraternitas Bruntruti et parrochia ad s. Petrum ibidem, necnon diversae capellaniae - Porrentruy: confré... (1321-1791)
A 75 Miracula - Miracles (1589-1758)
A 76 Miseracensis prioratus - Prieuré de Miserez (Jura) (1218-1752)
A 77 Missalia - Missels (1571-1789)
A 78 Missiones - Missions (1625-1789)
A 79 Moniales in episcopatu - Moniales dans le diocèse (1415-1791)
A 80 Moniales extra episcopatum - Moniales hors du diocèse (1261-1778)
A 81 Monitoria - Monitoires (1672-1790)
A 82 Murbacensis et Luderensis abbatia principalis - Abbaye princière bénédictine de Murbach (Ht-Rhin) et de Lure (Hte-Saône) (1338-1791)
A 83 Novalia - Dîmes novales ou nouvelles (cote vide)
A 84 Nuntius Lucernensis - Nonce du pape à Lucerne (1555-1765)
A 85 Officialitas Basileensis - Officialité de Bâle (et Chambre ecclésiastique) (1429-1792)
A 86 Olspergensis abbatia - Abbaye d'Olsberg (Argovie); religieuses de l'ordre de Cîteaux - Akten betr. das adelige Zisterzie... (1381-1791)
A 87 Ottmarsheimensis abbatia - Couvent féminin d'Ottmarsheim (Ht-Rhin) (1461-1790)
A 88 Parisium - Abbaye cistercienne de Pairis (Ht-Rhin) (1449-1788)
A 89 Parrochiae in Elsgaudia Bisuntinensis dioecesis - Paroisses d'Ajoie relevant du diocèse de Besançon (1254-1792)
 A 89/1 Acta generalia capituli Elsgaudiae Bisuntinensis dioecesis ab anno 1779 capituli Ajojae, basileensis diocesis (1404-1790)
 A 89/1-1 Généralités sur le chapitre d'Ajoie du diocèse de Besançon - Generalia capituli Elsgaudiae bisuntinensis dioecesis (1404.02.17-1772)
A 89/1-2 Imprimés: mandements et ordonnances de l'archevêque de Besançon (1717-1762)
A 89/1-3 Généralités concernant le doyenné d'Ajoie (diocèse de Bâle) - Generalia capituli Ajojae (1784.10.30-1790.10.28)
A 89/1-4 Mandements au sujet de l'échange de paroisses entre les diocèses de Besançon et de Bâle (1781)
A 89/1-5 Conférences des curés d'Ajoie - Conferentiae inter presbyteros curatos capituli Ajojae. (1787)
A 89/2 Paroisses d'Alle, Boncourt, Bonfol et Vendlincourt - Akten betr. die Pfarreien Hall, Bubendorf, Pumpfel und Wendelinsdor... (1481-1791)
A 89/3 Paroisses de Bressaucourt, Buix et Bure - Akten betr. die Pfarreien Bressaucourt, Buchs und Bure (1371-1790)
A 89/4a et b Paroisse de Chevenez - Akten betr. die Pfarrei Kevenach (1492-1792)
A 89/5a Paroisses de Coeuve et Cornol - Akten betr. die Pfarreien Kuef und Cornol (1416-1792)
A 89/5b Paroisse de Courchavon - Akten betr. die Pfarrei Vögtsburg (1254-1792)
A 89/5c Paroisse de Courgenay - Akten betr. die Pfarrei Jensdorf (1254-1792)
A 89/6a Paroisses de Courtedoux, Courtemaîche et Damphreux - Akten betr. die Pfarreien Courtedoux, Courtemaîche und Damphreux (1470-1792)
A 89/6b Paroisses de Beurnevésin et Damvant - Akten betr. die Pfarreien Brischwiler und Damvant (1470-1792)
A 89/7 Paroisse de Grandfontaine - Akten betr. die Pfarrei Grandfontaine (1330-1789)
A 89/8 Paroisses de Fahy, Fontenais et Villars, Milandre (oratoire du château) et Montignez - Akten betr. die Pfarreien Fahy, F... (1548-1790)
A 90 Parrochiae extra episcopatum - Paroisses hors du diocèse (1762)
A 91 Pontificum summorum obitus et electiones - Mort et élection des souverains pontifes (1484-1775)
A 92-93 Predicatores - Frères prêcheurs (1278-1786)
A 94-95 Praepositurae et prioratus in et extra episcopatum - Chapitres et prieurés dans et hors du diocèse (1100-1790)
A 96 Preces publicae - Prières publiques (1529-1792)
A 97 Privilegia papalia - Privilèges pontificaux (1049-1649)
A 98 Religio catholica - Religion catholique (1336-1789)
A 99 Rhenofeldensis ecclesia collegiata - Collégiale [St-Martin] de Rheinfelden (Argovie) (1228-1792)
A 100 Seminarium - Séminaire (1576-1793)
A 101 Stipendia - Bourses (1512-1791)
A 102 Suffraganeus Basiliensis - Suffragant du diocèse de Bâle (1498-1788)
A 103 Sulzbergensis abbatia in Brisgaudia - Abbaye [St-Cyriak] de Sulzburg dans le Brisgau (bénédictines) (0993-1629)
A 104 Synodalia et statuta Basiliensia - Synodes et statuts du diocèse de Bâle (0812-1788)
A 105 Thannensis ecclesia collegiata - Chapitre de chanoines [de Saint-Amarin] de Thann (Ht-Rhin) (1255-1790)
A 106 Teutonicus ordo - Ordre des Chevaliers teutoniques (1567-1785)
A 107 Vicarius generalis - Vicaire général (1495-1786)
A 108 Visitatio liminum apostolorum - Visite des évêques au Saint-Siège (1585-1790)
A 109a Visitationes in episcopatu - Visites pastorales dans le diocèse (1490 (env.)-1792 (env.))
A 109b Visitationes praefecturarum in Principatu in genere - Visitationen der Oberämter und Herrschaften in civilibus - Visites... (1753-1789)
A 110 Universitas Friburgensis - Université de Fribourg-en-Brisgau (1610-1785)
A 111 Universitas Basileensis - Université de Bâle (cote vide)
A 112 Ursicini Sancti ecclesia collegiata - Chapitre de chanoines de Saint-Ursanne (1095-1806)
A 113 Ursulinae Bruntruti - Ursulines de Porrentruy (1572-1793)
A 114 Ursulinae Delemonti - Ursulines de Delémont (1662-1788)
A 115 Zwingensis Capellania aulica - Chapelle aulique de Zwingen (cote vide)
B Temporalia, administration temporelle (principauté) (11e s.-18e s.)
C Comptes - Rechnungen (1407-1830)
 Cod. Codices - Bücher (registres de chancellerie et autres registres) (1290-1792)
Justice (1340-1797)
OJ Ordre judiciaire (1461-1809)
Bailliages - Vogteien
Varia
Révolution et Empire (1792-1814)
Principauté de Porrentruy (régences Andlau et Escher) - Fürstentum Pruntrut (Verwaltungen von Andlau und Escher) (1814-1815)
Notaires (1470-1845)
Collections (0878-20e s.)
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